El Laboratorio cuenta con un riguroso sistema de control de calidad acreditado por el Programa de Acreditación del Laboratorio (PAL) de la Fundación Bioquímica Argentina (FBA) y participa activamente en varias especialidades del Programa de Evaluación Externa de la Calidad (PEEC) perteneciente a la FBA. Además ha participado, junto a la Institución , en las distintas etapas de Acreditación por parte del CENAS y de CIDCAM, proceso que lleva más de 10 años de trabajo continuo.